Toto se tu už jednou řešilo :-) Bohužel se asi jedná o nepříjemnou chybu Slaxu, osobně jsem neměl tu trpělivost prověřit chování napříč vydanými verzemi. Vyrob si changes.dat s tvým nastavením, a ten v případě problémů jednoduše překopíruj a ber na vědomí, že ne vše co uložíš do změn tam zůstane, ukládej vždy na oddíl hdd s fat32 a budeš mít klid.