Čteš poctivě výpisy po jednotlivých emerge? Doporučuju emergnout elogv a nastavit (ukládá je k přečtení do budoucna).
Koukni se, jakou máš verzi K3B a jakou jsi měl předtím (k tomu pomůže zase nástroj genlop - ten přehrabe emerge.log a vytáhne z něj historii emerge balíku). Zkusil bych předchozí verzi. Možná taky jak píšou jiní, co třeba dBus? Nebo jiná podobná věc. eselect news nic nového nemá?
Jak máš nastavené USE flags? Pošli sem řádek USE z make.conf, případně obsah souboru /etc/portage/package.use
Neblokuješ nějaké verze balíků? Abys nenarazil třeba na nekompatibilitu starší verze něčeho a novější něčeho jinýho... (to by ale měl emerge hlásit...)