Měl jsem stejný problém. Matlab používá jako výchozí font pro popisky os nebo nadpis grafu font Helvetica. Ten se v mé distribuci nevyskytuje, takže jsem to vyřešil výměnou výchozího fontu.
Pomocí následujících příkazů je možné si vypsat font, který chce Matlab použít:
get(0,'DefaultAxesFontName')
get(0,'DefaultTextFontName')
Je-li to skutečně Helvetica, kterou nemáte možnost automaticky doinstalovat, stačí font změnit např. na Liberation Sans (je-li nainstalován ;-)) pomocí:
set(0,'DefaultAxesFontName','Liberation Sans')
set(0,'DefaultTextFontName','Liberation Sans')
Tyto dva řádky jsem doplnil do souboru startup.m, který se musí nacházet v proměnné path. Já mám v této proměnné např. adresář ~/matlab, takže startup.m jsem nahrál tam a změna fontů se tedy provede vždy automaticky po stuštění Matlabu.