To je zvláštní, u mě je 3D desktop ve všech případech lepší (radeon a intel karty, vždy s ubuntu+gnome).
Zajímavé taky je, že s proprietárními ovladači Radeon karty (FGLRX+Compiz) si můžu nastavit "tear free desktop on/off". Při zapnutém tear-free je všechno dobré až na trhané video (žere to víc prostředků GPU), při vypnutém tear-free se to chová velmi podobně jako OSS ovladače ve 2D - tj. není to trhané, ale "tearinguje" to. Video si musím pustit s OSS ovladačem, ale s Compizem, jinak se na to nedá dívat.