Chlapi díky za podněty.
x11vnc jsem si zkusil rozjet na jiném portu a taky mi v něm nefunguje clipboard. Ve Windows jsme zkoušel i klienty RealVNC nebo TigerVNC.
Do spouštění 'x0vncserver -display :0 -rfbport 5901 -passwordfile /home/***/.vnc/passwd -SendCutText -AcceptCutText' jsem přidal zmíněné příkazy, ale ani ty mi nefungují.
On mi clipboard fungoval kdysi s nativním VNC serverem v Ubuntu, kterým je vino-server, jenže ten po nějaké aktualizací přestal fungovat. Kvůli němu jsem i spouštěl v rc.local přikaz 'gsettings set org.gnome.Vino require-encryption false', protože klienti ve Windows toto šifrování neuměly (kdysi).
P.S. Ještě jsem někde zaznamenal nainstalovat spouštět 'autocutsel -fork', ale to mi také nefunguje.