Mně něco podobného dělají aplikace (asi jen ty založené na WebKitu/Blinku) na 4K monitoru. Neděje se to po restartu počítače, ale po probuzení – může to tedy být podobný průběh, že se aplikace zobrazuje na monitoru, který v tu chvíli ještě není zapnutý. To, co chybí, je horní pruh aplikace – zůstane tam vykreslený předchozí obraz, případně později černá, a aplikace v tom místě nereaguje na myš. Není to ale chyba aplikace, nýbrž systému – myš nereaguje ani na záhlaví okna a tlačítka pro minimalizaci a zavření.
Bohužel se mi ale nikdy nepodařilo zjistit, čím přesně to je. Obvykle pomáhá ten monitor vypnout a znovu zapnout. Také myslím ve Windows existuje nějaká magická kombinace kláves na restart grafického subsystému. Napadá mne jediná věc – mám pocit, že už jsem to nějakou dobu nezaznamenal. Na vašem místě bych tedy zkusil nainstalovat všechny dostupné aktualizace Windows.