Tak možností je více. V PHP kde je situace obdobná, jsem to vždycky řešil přes konfiguraci. Prostě v konfiguraci aplikace - nějaký JSON - je nastaveno to co je potřeba k tomu, aby se aplikace nahodila do vývojového režimu. Tuhle konfiguraci si aplikace načte a pracuje s tím, "ifuje" se podle tohoto.
U javascriptu pak lze využít toho odkazovaného modulu do webpacku, případně i bez pluginu myslím přes npm script volat webpack s nějakými environment proměnnými a webpack je sám "vymění".