Moc nevěřím, že je běžné, aby šel VRM pro GPU vypnout fidláním s power states v PCI zařízení. Čekal bych že se tím třeba odstaví/deaktivují nějaké interní bloky, hluboce se uspí, ale šváb zůstane pod napětím.
Jinak doporučuji dotaz do Googlu "lspci setpci power state" a přečíst prvních pár odpovědí. Nakonec tam tuším není konkrétní návrh s použitím setpci, ale i tak je to zajímavé čtení.
Pokud byste dokázal té kartě třeba nějakým FETem vypnout vnější přívod 12V, tak by to mohlo mít nějaký vliv. Pokud by se nesnažila přežít ze 12V z PCI slotu (v tom případě by patrně lehnul celý systém, protože by to motherboard neutáhl.)
Samotná PCI sběrnice by měla podporovat hot swap. Uhh... a nejsem si jist, jestli prostě vypnutím napájení dosáhnete stavu "proběhlo odpojení od sběrnice". V PCI-e slotu jsou piny PRSNT#1 a PRSNT#2 (PRSNT#2 je několik, podle šířky sběrnice) -
pokud je karta na plošáku navzájem propojí, tak při zasunutí karty dojde k "detekci zasunutí" motherboardem (upstream bridgem). Nejsem si jist, že je ten popis správný - protože se tam taky píše, že PRSNT#1 je na motherboardu uzemněný. Možná jsou plošky na kartě ještě navíc kratší. Jestli jde toto nějak nafintit u onboard naletovaného PCI-e zařízení (uzemněním PRSNT#2), na to není obecná odpověď :-) Pravděpodobně nikoli.
Viz též.