Hibernovaný systém (suspendovaný na disku) se IMHO sám neprobudí.
Fast Startup, jak se toto menuje, při vypnutí počítače odhlásí uživatele a samotný systém suspenduje na disk, protože suspendovaný systém se při zapnutí počítače resumuje rychleji, než kdyby se musel znovu spouštět od začátku.
Nevím, jestli na toto existuje nějaké konkrétní řešení, ale osobně bych prvně googloval zda existuje, a nebo bych si zajistil probuzení počítačů buď mocí časovače v BIOSu, což bude pakárna automatizovat, pokud počítač nemá nějaký enterprise BIOS s remote managementem, a nebo je probudit přes WOL (obstará server). Následně si může na počítači spustit script co vyhledá a nainstaluje aktualizace a ještě po sobě restartuje počítač, by byla instalace dokončena. Následně po sobě počítač zase vypne. Ráno budou počítače vypnuté a aktualizované.
Pokud chceš simulovat aktualizaci, doporučuju to udělat pomocí snapshotů ve virtuálce, kdy se budeš vracet k čistému systému, místo je opětovné instalace. Nejsem si vědom žádného parametru, který by aktualizaci pouze simuloval.