Tak úplně nejsnazší způsob je použít Zentyal (nejlépe instalovat jako headless server, Ubuntu server 14.04 pouze s SSH + Zentyal z repozitáře), a používat to jak pro Windows, tak Linux. A k tomu bych doporučil OpenSUSE 13.1, protože připojení do domény je díky YaSTu velmi snadné.