Pokud se jedna o jednorazovou ulohu, jako prvni pokus bych zkusil prekopirovat ten soubir na Linux a napsat skriprik v perlu 5.x.
Java nebo .Net bude na toto IMHO pomerne pomaly z duvodu jeji h zpusobu prace s pameti.
A ani bych se nebal v perlu si vyhledane udaje ruznych typu narvat do hashmaps a pak vzajemne korelovat.
Perl je na tyto ucelynprekvapivne rychly.
Chce to ale system se slusnou implementaci perlu a se slusnym memory mngmt, to wokenice rozhodne nejsou.