jQuery je dobre, rozhodne na nej nenecham dopustit. Ale je to jen takovy univerzalni nastroj, ktery pouzivam spise kdyz pisu kratke user-scripty. Na psani celych aplikaci se moc nehodi. Rozhodne je nutne ho nejak znat, jak piseste, dost knihoven/komponent na nem zavisi. Parkrat jsem musel sahnout po jQuery i pri praci v Angularu, ale je to opravdu vyjmecne, neco jako jedno pouziti jQuery na tisice radku kodu.
S webpackem se celkem dobre zacina, gulp bych do zacatku urcite neradil (navic IMO jeho popularita klesa na ukor ostatnich reseni - treba webpacku a npm skriptu).