Je to tak, jak píše Ondra. Je to známá věc, že Java ve starších verzích nezná IdenTrust, takže nevěří Let's Encrypt. Certifikáty jsou v pořádku, stejně jako konfigurace serveru. Problém je v neaktualizované Javě. Takže buď je potřeba aktualizovat nebo alespoň (pokud je to možné), přidat mezi důvěryhodné kořenový certifikát IdenTrust.