balicek (pokud nebyl vyroben prasacky) se instaluje do /usr
"configure && make && make install", tedy instalace po kompilaci ze zdrojoveho kodu, instaluje do /usr/local/ (pokud si to nezmenis)
poradi v kterem se hleda urcuje promena $PATH, tedy pokud si to nezmenil, tedy nejdriv z /usr/local/(s)bin, pak v /usr/(s)bin (resp. uplne nejdriv z /home/tvuj/bin)
programy instalovane pomoci "make install", jdou odinstalovat pouze pokud Makefile obsahuje tuto moznost, pak pomoci "make uninstall", odinstalace je "tupa", tedy nezjistuje jestli maze opravdu stejne soubory co to instalovalo, jednoduse je odstrani
osobne doporucuju v pripade potreby novejsi verze programu bez je v repositari (predpokladam pouzivas *buntu/Mint), pridat PPA (nejaky osobni/komunitni repozitar) ktery novejsi verzi opravuje, dostanou se tam k tobe automaticky aktualizace, nemuzes si nic podelat...
pokud uz bys potreboval opravdu rucni kompilaci, tak neinstalovat pomoci "make install", ale vytvaret si balicek *.deb(s tim ze zachovas prefix /usr/local, protoze tim se muzes odlisit(nezasahovat) od(do) souboru oficialniho balicku), kterej nainstalujes (a odinstalujes) mnohem systemoveji a je mnohem mensi sance ze neco podelas