Myslím, že otázka zněla trošku jinak, tazatel se ptá, proč se nepoužívají ani privátní repozitáře na GitHub.
Upřímně řečeno, spousta administrátorů je paranoidních - z mé zkušenosti se často více řeší kraviny, než reálná bezpečnostní rizika, ale tak to prostě je.
Nicméně u cloudových služeb je otázek docela dost. Zpočátku jsem cloudové služby hodně propagoval, ale po čase jsem sám narazil na dost limitů - od právní stránky věci (uložená data v cizí zemi), po stabilitu (výpadky menších cloudových služeb jsou docela problém), po konektivitu (například udělat si clone 1GB repozitáře GITu, co má i data a obrázky atd.. je docela zdlouhavé po internetové lince) až po zálohy (zálohování cloudových služeb se blbě automatizuje a řeší nějak koncepčně). Bezpečnost je otázka zajímavá, adminisrátoři argumentují stylem "nedáme data třetím stranám", ale ono kolikrát data zlikvidují a zneužijí samotní administrátoři, takže ono je riziko mít jednoho poloboha ve firmě - ale to už admin nevidí, protože on je ten polobůh.
Co vidím ovšem jako hlavní problém je, že u hodně cloudových služeb nejsou moc výhody - jaké získám výhody použitím GitHubu s privátním repozitářem? Vždy je třeba vše posuzovat individuálně a brát to s rezervou.
Já si například myslím, že maily v cloudu je lepší volba než maily ve firmě. A to z toho důvodu, že nechci mít několik lidí, co si mohou číst firemní maily jako zaměstnance. Ano, v cloudu si může NSA nebo zaměstnanec Google v Californii přečíst, kolik bere vývojář v naší firmě od vedle - ale to asi stěží zneužije. Na druhou stranu, když si admin přečte, kolik bere jeho kolega ;-)