V debiane by default bezi Apache pod uzivatelom www-data a skupina www-data. Pokial si v konfiguracii apacha nezvolis ineho uzivatela. Mozes si to overit aj cez prikaz 
ps -u www-data
  a vysledok by mal vypadat nejak tatko:
web# ps -u www-data
  PID TTY          TIME CMD
 1200 ?        00:00:00 apache2
 1205 ?        00:00:00 apache2
20776 ?        00:00:00 apache2
31606 ?        00:00:00 apache2
[/quote]
presne tka to mam od defaultu ako si napisal 

a kedze som ssl certifikat dal len pre root a root skupinu tak to funguje presne kao si napisal pod rootom si len zoberie konfiguracne subory a pak uz bezi pod ww....
[/quote]
Osobne som s ssl certifikatmi nemal prolem aj ked ich vlastnil root. Kedze apache si config suid-ne pod www-data pri spusteni procesu a tahani vsetkych modulov. Akurat si musis vsetky potrebne moduli zapnut cez a2enmod. Kedze od urciteho casu sa v debiane ssl a ine moduli po instalacii apache2 nezapnu.