Scientific Linux robí dojem dosť minoritnej distribúcie.
SL je především výchozí platforma pro laboratoře CERNu a Fermilabu. Tedy, mají základní OS, kde mají společné nutné věci (jako OpenAFS, které například v CentOSu v základu není) a každá jednotlivá laboratoř si pro své účely dodá vlastní software a tím si vlastně vytvoří vlastní distro.
Toto asi obecnou veřejnost moc nezaujme.
Tedy SL vychází z RedHatu, ale SL nerovná se RH. Mají tam vlastní úpravy, bohužel vlastní chybu a nejsou (ani se o to nesnaží) být s RH binárně kompatibilní.
Cíle CentOSu jsou jiné, tam je snaha o 100% kompatibilitu s RedHatem. Proto také vydání 6.0 trvalo tak dlouho. v SL to vydali ve chvíli, kdy s tím byli sami spokojeni, zatímco v CentOS ve chvíli, kdy jim to prošlo testy.