To zapik1:
Asi si úplně nerozumíme... Myslím, že to co jsi popsal je právě postup, který uvádím v bodu 1.
Když vytvořím v rootu NC složku Dokumenty a do ní nechám synchronizovat např. C:\Users\"Uživatel"\Dokumenty, je vše ok. Když složku nevytvořím, bude to sypat do kořenu NC a NC si složku Dokumenty taky nevytvoří.
Takže jsem ručně vytvořil v kořenu NC složku a do ní vybral/připojil zdrojový adresář Windows.
Teď, když chci připojit další složku (třeba Downloads) k synchr. z Windows, musím výše uvedený postup opakovat, protože musím zvolit i nějakou cílovou složku na NC a na výběr mám pouze root (Nextcloud) anebo mnou vytvořený a už synchronizovaný adresář Dokumenty. Pokud tedy postup neopakuji (nevytvořím na NC složku ručně), mám možnost to buď synchronizovat do rootu NC anebo do mnou vytvořené podsložky na NC, tedy /NC/Dokumenty.