Je to tak. Bash má historii v paměti a po ukončení ji zapíše do .bash_history. Tím pádem tam bude historie z toho posledního.
Ono to jde nastavit, aby se to tam zapisovalo hned, tím tam budou sice všechny příkazy, ale míchá se to mezi více shelly, takže když děláte v jednom něco a v druhém něco jiného, tak se to bude motat. Takže jsem to měl jen chvilku, nezvyk jsem si a zrušil jsem to.