Nebudu sem psát konkrétní příkazy, spíše Vás nakopnu a jistě dohledáte zbytek. Momentálně se děje skutečně to, co popisujete - odpověď z sFTP serveru opravdu odchází WAN1. Problém dvou (a více) WAN se často řeší více routovacími tabulkami a následně značkováním paketů (mangle-prerouting, mark-connection a následně mark-routing). V principu jde o to, že označíte spojení přicházející na sFTP z WAN2 a následně označíte odchozí pakety, aby si hledaly bránu v druhé routovací tabulce, kde je pouze výchozí routa do WAN2 (případně routa s menší vzdáleností).