Pokud oprava spočívá v editaci /bin/yum, tak se obávám, že to nejbližší update yumu zase rozbije. Část souborů si může uživatel měnit dle svého, část spravuje například správce balíčků. Když upravíte soubor spravovaný správcem balíčků, při aktualizaci jej nejspíš nahradí novou verzí, a nebude udržovat vaše úpravy.
IIUC jste přesouval Python nebo tak něco. Tomuto bych se vyhnul, Python v systému má svoje místo, na které se spoléhají další balíčky.