V x2go klientovi kolem klávesnice nic nenastavuji. Používám Debian a desktopové prostředí Mate. Klávesnici si nastavím až v Mate. Přepínání rozložení klávesnice si pak schválně také nastavuji na Alt+Shift jako to je defaultně ve Windows.
Co mne na x2go vytáči při užití klienta na Windows je, že kombinací Alt+TAB se přepnu zpět na nějakou aplikaci ve Windows místo toho abych zůstal ve fullscreen prostředí na Linuxu. Zajímavé je, že x2go klient pro Linux tohle nedělá.